Odată cu încheierea monitorizării maturării foliculare, atunci se realizează puncția foliculară transvaginală. Extragerea ovucitelor se realizează cu ajutorul ecografului, este nedureroasă, scurtă și poate fi urmărită și de către soț. La cerere se poate face și anestezie. Embriologi colectează ovocitele din lichidul folicular care apoi sunt dep ținute într-o cultură specială în incubatoare. Imediat după recoltare soțul va trebui să doneze materialul seminal. Unii bărbați ar putea întâlni dificultăți în a da materialul seminal în momentul respectiv. Dacă există această problemă, atunci soțul ar trebui să discute cu medicul pentru a da materialul seminal din zilele precedete, astfel va fi disponibil în momentul în care va fi nevoie de el.
Ovulele au o morfologie caracteristică. În mijlocul distinge ovocitul înconjurat de celule de paza, textură caracteristică și morfologie numit cumulus.